Структура

І. Керівництво

• Директор інституту
• Заступник директора з наукової роботи
• Заступник директора з наукової та організаційної роботи
• Керівник Відділення ( м. Дніпро)
• Учений секретар

II. Науково-дослідні підрозділи

• Відділ проблем регуляторної політики і розвитку підприємництва
• Відділ проблем інноваційно-інвестиційного розвитку промисловості
• Відділ проблем перспективного розвитку паливно-енергетичного комплексу
• Відділ економічних проблем соціальної політики

– Сектор проблем розвитку людського капіталу

• Відділ економічних проблем розвитку промислового виробництва
• Відділ фінансово-економічних проблем використання виробничого потенціалу

– Сектор проблем податково-бюджетної політики

• Відділ проблем економіки підприємств

Відділення проблем соціальної економіки та регіональної політики (м. Дніпро)

• Сектор структурної динаміки просторових утворень Відділу проблем регуляторної політики і розвитку підприємництва
• Сектор проблем трансформації економіки промислових регіонів в умовах децентралізації управління Відділу економічних проблем розвитку промислового виробництва (розташований у м. Краматорську)

III. Науково-організаційні підрозділи

• Відділ інформатизації наукової діяльності

IV. Допоміжні та інші підрозділи інституту

• Наукова бібліотека, архів
• Відділ бухгалтерського обліку та звітності. Планово-економічний відділ.
• Відділ кадрів, аспірантура. Учена рада, секції ученої ради, спеціалізована учена рада
• Канцелярія
• Штаб ЦО. Охорона праці, пожежна безпека
• Пансіонат «Наука» (розташований у Лиманському районі Донецької обл.)